Základy bioinformatiky

Zápisky (v1.1.0, poslední update 16. 5. 2019)

K dispozici je odkaz na webovou verzi a na dokument pdf. PDF verze je WIP, prosím, hlašte chyby nebo nápady na vylepšení.

Řešení bonusových úkolů jsou k dispozici zde.

Informace o zkoušce

zkouška se skládá ze dvou částí, celkově je za 50 bodů: písemná část (80%) a paper (20%), plus je možno získat bonusové body (maximálně 14)
většina informací (úkoly, cvičný test, témata na paper, termíny cvičení) bude na Moodlu
písmená část (40 bodů)
- dlouhý test, zkušební bude na Moodlu
- otestována budou dosti podrobně všechna témata
- doporočeno vzít si s sebou pití a jídlo
paper (10 bodů + 3 bonusové)
- zpracovat téma jednoho ze zadaných článků (použít ale i jiné zdroje)
- uvést i osobní komentář: jaký to má přínos, jak to funguje, co si o tom myslím (viz News and views v časopise Nature)
- nejlepší papery budou v zápočtovém týdnu prezentovány
domácí úkoly (dva po 3 bodech)
- nepovinné (narozdíl od úkolů ve cvičení, viz níže)
- lze je plnit samostastně nebo ve skupinách
- jsou za bonusové body, které se počítají u zkoušky
rozšíření wikipedie (5 bodů)
- rozpracovat téma týkající se bioinformatiky (nejprve konzultovat s Mariánem)
- opět bonusové body ke zkoušce

vypracování všech cvičení je povinné
není nutné vypracovávat je osobně na cvičeních, ale do zkoušky je nutné všechna cvičení odevzdat
návod na jednotlivá cvičení je na Moodlu

Lesk, A. (2008): Introduction to Bioinformatics
Jones, N. C. & Pevzner, P. A. (2004): An Introduction to Bioinformatics Algorithms
Zvelebil, M. & Baum, J. (2007): Understanding Bioinformatics
- dostupná v knihovně